RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP44Q9C0F1 390 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL33A6NCF5 533 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 KPNA5O15131 536 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PRKD3O94806 890 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PON2Q15165 354 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 BROXQ5VW32 411 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 NCLNQ969V3 563 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 TOR3AQ9H497 397 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 SERHLQ9NQF3 203 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 WNT9AO14904 365 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 AREL1O15033 823 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PFKLP17858 780 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 LHCGRP22888 699 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 SHMT2P34897 504 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 GZMMP51124 257 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 CARD16Q5EG05 197 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 TMC8Q8IU68 726 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 OR5K1Q8NHB7 308 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM118AQ9NWS6 357 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 GRM6O15303 877 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP2A7P20853 494 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP2R2BQ00005 443 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 CTBSQ01459 385 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 SEMG2Q02383 582 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 GTDC1Q4AE62 458 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 LEFTY2O00292 366 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 C1SP09871 688 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 SPINT3P49223 89 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 AP1S2P56377 157 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PHC1P78364 1004 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ABHD18Q0P651 414 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 BIRC2Q13490 618 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 GPR107Q5VW38 600 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 EID3Q8N140 333 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 LZICQ8WZA0 190 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAJC11Q9NVH1 559 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 H3BMQ9 156 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PER2O15055 1255 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 LRG1P02750 347 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ELK4P28324 431 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 EMP3P54852 163 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF33BQ06732 778 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 TUBA3CQ13748 450 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 COG8Q96MW5 612 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 BRD9Q9H8M2 597 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PLGRKTQ9HBL7 147 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 HTTP42858 3142 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM64BA6NI03 449 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 GFYI3L273 518 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 LILRB3O75022 631 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 YAP1P46937 504 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 NRBF2Q96F24 287 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 MBOAT4Q96T53 435 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 BNIP3LO60238 219 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 ABCB7O75027 752 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 FKTNO75072 461 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-202ENST00000399409 OR13F1Q8NGS4 319 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms