RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384388.1

RNU6-31P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 31, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-31P, Length 108 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-31P-201ENST00000384388 NDC80O14777 642 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PRAF2O60831 178 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 NUDT3O95989 172 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 AHCYP23526 432 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PIK3R1P27986 724 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 MMP13P45452 471 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PDX1P52945 283 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 HTD2P86397 168 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 COL10A1Q03692 680 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 ZNF234Q14588 700 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CALCRLQ16602 461 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PTOV1Q86YD1 416 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 Q8N1X5 172 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 AMER3Q8N944 861 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 L3MBTL4Q8NA19 623 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CNNM3Q8NE01 707 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CFAP36Q96G28 342 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 RGSL1A5PLK6 1076 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 INAFM1C9JVW0 142 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 HSF2BPO75031 334 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 FAM200BP0CF97 657 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 FAM106CPP0CH98 169 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 STAG3L1P0CL83 205 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 ACP2P11117 423 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PRF1P14222 555 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 MYOD1P15172 320 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CSF2RAP15509 400 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CCNA2P20248 432 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TNFRSF1BP20333 461 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 IL15P40933 162 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 MNDAP41218 407 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CAMLGP49069 296 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 GMFBP60983 142 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 RUNX1T1Q06455 604 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 ARHGAP1Q07960 439 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CA9Q16790 459 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 XKR9Q5GH70 373 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 KCTD11Q693B1 232 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 BTNL8Q6UX41 500 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 LINGO4Q6UY18 593 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 FJX1Q86VR8 437 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 APCDD1Q8J025 514 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 BATF2Q8N1L9 274 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 SLC26A7Q8TE54 656 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TANKQ92844 425 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 P2RX5Q93086 422 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PYCR2Q96C36 320 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 SPATA13Q96N96 652 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 ZNF559Q9BR84 538 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 CDK19Q9BWU1 502 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PANK2Q9BZ23 570 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 DCLK3Q9C098 648 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 EBF3Q9H4W6 596 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 RAB9BQ9NP90 201 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 AURKCQ9UQB9 309 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-31P-201ENST00000384388 LILRA5A6NI73 299 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms