RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 AQP9O43315 295 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS17P08708 135 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPAN8P19075 237 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 IMPA1P29218 277 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUOXA1Q1HG43 343 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 FRMD7Q6ZUT3 714 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD244Q9BZW8 370 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PI4KAP42356 2102 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF318Q5VUA4 2279 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 E2F3O00716 465 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIAS2O75928 621 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HOXD12P35452 270 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL14P50914 215 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKS6Q68DC2 871 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 IYDQ6PHW0 289 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAVSQ7Z434 540 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCAIMQ8N3R3 496 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPFIBP2Q8ND30 876 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBTD2Q8WUN7 234 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PYCR2Q96C36 320 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 UCKL1Q9NWZ5 548 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCTPQ9UKL6 214 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 YY2O15391 372 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GGT5P36269 586 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC19A1P41440 591 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGTRAPQ6RW13 159 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GKN2Q86XP6 184 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAGSQ8N159 534 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF480Q8WV37 535 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERP27Q96DN0 273 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAMK1GQ96NX5 476 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL17FQ96PD4 163 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 EBF4Q9BQW3 602 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYLK2Q9H1R3 596 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MVB12BQ9H7P6 319 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF195O14628 629 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBOX5O94941 541 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINB3P29508 390 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 BNIP3Q12983 259 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIK2Q13002 908 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTCHD3Q3KNS1 767 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATL1Q8WXF7 558 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXorf40BQ96DE9 158 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP6CO00743 305 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 STK16O75716 305 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPP6P42658 865 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC6A12P48065 614 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 HK2P52789 917 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHBQ15464 509 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPRED3Q2MJR0 410 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP76Q8TAP6 659 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMOQ9BU70 441 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBTB26Q9HCK0 441 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLG2Q9UHN1 485 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 B4DGG1 531 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD65E5RJM6 399 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLCQ05315 142 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYTL1Q8IYJ3 562 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 RILPQ96NA2 401 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 MENTQ9BUN1 341 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAPN10Q9HC96 672 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 OPTCQ9UBM4 332 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFP69BQ9UJL9 534 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNA1EQ15878 2313 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAE1Q13564 534 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 DEFB133Q30KQ1 61 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALNTL6Q49A17 601 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM61Q5EBN2 209 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 RABEPKQ7Z6M1 372 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEX9Q8N6V9 391 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52E1Q8NGJ3 308 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPC4APQ8TEL6 797 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED8Q96G25 268 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMO7DNF2Z398 122 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 K7EPI3 171 aa26.88■■□□□ 1.89
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