RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CCNG1P51959 295 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ARFIP2P53365 341 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 PNLIPRP1P54315 467 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TBPL1P62380 186 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TRAF3Q13114 568 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SUSD1Q6UWL2 747 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CDYL2Q8N8U2 506 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ZNF382Q96SR6 550 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 NUF2Q9BZD4 464 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TMEM74BQ9NUR3 256 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TIMM22Q9Y584 194 aa17.26■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 A6NCN8 305 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 GIPC1O14908 333 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 VILLO15195 856 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CSF2P04141 144 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 NME1P15531 152 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ERVPABLB-1P60509 514 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 LETMD1Q6P1Q0 360 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 OR4F6Q8NGB9 312 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 LMX1AQ8TE12 382 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CXorf40BQ96DE9 158 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 BTRCQ9Y297 605 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa17.25■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 B4DGG1 531 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 MATN2O00339 956 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ZNF195O14628 629 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 AZIN1O14977 448 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 F3P13726 295 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ANGPT1Q15389 498 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 OR56A3Q8NH54 315 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 PIGKQ92643 395 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 OR4K3Q96R72 315 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ERICH4A6NGS2 130 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 E7ENX8 843 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 HDAC3O15379 428 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ESRRBO95718 433 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 OTCP00480 354 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SP9P0CG40 484 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 PIK3CGP48736 1102 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 IDH3AP50213 366 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 NAA20P61599 178 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TAP2Q03519 686 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TEAD4Q15561 434 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 LPAL2Q16609 132 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 KANK2Q63ZY3 851 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 WASH2PQ6VEQ5 465 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 MILR1Q7Z6M3 343 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 C11orf74Q86VG3 221 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 OR52E1Q8NGJ3 308 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 MVB12BQ9H7P6 319 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 WASH6PQ9NQA3 447 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 FSCN3Q9NQT6 498 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 KCNK4Q9NYG8 393 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SH2B3Q9UQQ2 575 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 RNF11Q9Y3C5 154 aa17.24■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GTW7 788 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 FFAR3O14843 346 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 GPR42O15529 346 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SLC19A1P41440 591 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 PKNOX1P55347 436 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 BTKQ06187 659 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CDC16Q13042 620 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SCIMPQ6UWF3 145 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 PRR23BQ6ZRT6 265 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 TRIM48Q8IWZ4 208 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 FAM46DQ8NEK8 389 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 RILPQ96NA2 401 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 MENTQ9BUN1 341 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ACTR8Q9H981 624 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 ICKQ9UPZ9 632 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa17.23■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 E7EQ34 232 aa17.22■□□□□ 0.35
LTV1-201ENST00000367576 CAPN1P07384 714 aa17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms