RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 A0A0U1RQJ8 604 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 DDAH2O95865 285 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 EGFP01133 1207 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ARSAP15289 507 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TNNI1P19237 187 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SYT1P21579 422 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TNNC1P63316 161 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TRPC3Q13507 836 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 RETSATQ6NUM9 610 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 FAM171BQ6P995 826 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SYT13Q7L8C5 426 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 KBTBD6Q86V97 674 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 NAGSQ8N159 534 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 PDILTQ8N807 584 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 IQUBQ8NA54 791 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 HMGB4Q8WW32 186 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA17Q96L03 361 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 IL17FQ96PD4 163 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SYT15Q9BQS2 421 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TNMDQ9H2S6 317 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 AKAP13Q12802 2813 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ATP8B3O60423 1300 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 COL4A2P08572 1712 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 DENND4CQ5VZ89 1909 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TULP2O00295 520 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 STX6O43752 255 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TACC1O75410 805 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 CAVIN2O95810 425 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 P4HA1P13674 534 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 BDNFP23560 247 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 AP3M2P53677 418 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ASIC1P78348 528 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 CDK18Q07002 472 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 DMC1Q14565 340 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF77Q15935 545 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 TBRG1Q3YBR2 411 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 STPG1Q5TH74 334 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 RBFAQ8N0V3 343 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 XXYLT1Q8NBI6 393 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 POC1AQ8NBT0 407 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 STKLD1Q8NE28 680 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA5Q8TBA6 731 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-204ENST00000367379 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 OTUB2Q96DC9 234 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 C8orf48Q96LL4 319 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 PKMYT1Q99640 499 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 MAGEF1Q9HAY2 307 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 GCNT4Q9P109 453 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SIX4Q9UIU6 781 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-204ENST00000367379 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.72□□□□□ -1.65
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