RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 VEZF1Q14119 521 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RCN2Q14257 317 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIR2DS3Q14952 304 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC39A14Q15043 492 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTGISQ16647 500 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 C2orf76Q3KRA6 126 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC158Q5M9N0 1113 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPDYCQ5MJ68 293 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 AWAT2Q6E213 333 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAPH1Q70E73 1250 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 NUDT13Q86X67 352 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 C4orf19Q8IY42 314 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CFAP206Q8IYR0 622 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 THAP8Q8NA92 274 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 OLIG1Q8TAK6 271 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MGARPQ8TDB4 240 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 IRGQQ8WZA9 623 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRT35Q92764 455 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PROX1Q92786 737 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 NEUROG1Q92886 237 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 P2RX5Q93086 422 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CENPTQ96BT3 561 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RTP4Q96DX8 246 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF479Q96JC4 524 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC2A11Q9BYW1 496 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 FKRPQ9H9S5 495 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRC4Q9HBW1 653 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCF7L2Q9NQB0 619 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPHK1Q9NYA1 384 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 VPS18Q9P253 973 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF7Q9UBF6 113 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MALT1Q9UDY8 824 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR83OSQ9Y284 106 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMED3Q9Y3Q3 217 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KNSTRNQ9Y448 316 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM17Q9Y577 477 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CKAP5Q14008 2032 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PPW3 197 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PRV1 198 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASPDHA6ND91 283 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SDR42E2A6NKP2 422 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 FLRT2O43155 660 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYNGR3O43761 229 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRAF2O60831 178 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTSVO60911 334 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RTN2O75298 545 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC22A3O75751 556 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC16A8O95907 504 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 GSRP00390 522 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLGP00747 810 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 IRF2P14316 349 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITIH1P19827 911 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 JAK1P23458 1154 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CD27P26842 260 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MNDAP41218 407 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KHKP50053 298 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 HTR6P50406 440 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDX1P52945 283 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADARP55265 1226 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DSCR9P59020 149 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 B3GALT5-AS1P59052 145 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 STX1BP61266 288 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ST8SIA6P61647 398 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 AP1B1Q10567 949 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIF19Q2TAC6 998 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC39A12Q504Y0 691 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CASC4Q6P4E1 433 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYB5D1Q6P9G0 228 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF449Q6P9G9 518 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms