RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 CREG1O75629 220 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO2B1O94956 709 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TTC4O95801 387 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CTAGE8P0CG41 777 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC39Q96DD0 335 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TCTN2Q96GX1 697 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINB12Q96P63 405 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 TCF12Q99081 682 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KRT12Q99456 494 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 E7EQ34 232 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 H3BMM5 538 aa7.39□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 FMO4P31512 558 aa7.39□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 SYTL1Q8IYJ3 562 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 GPR135Q8IZ08 494 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 DSELQ8IZU8 1212 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.39□□□□□ -1.23
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