RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 NPTX1Q15818 432 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 AMZ2Q86W34 360 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 UPB1Q9UBR1 384 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 HMGN1P05114 100 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CPN2P22792 545 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CSKP41240 450 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GRK6P43250 576 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 HMGCS1Q01581 520 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OGDHQ02218 1023 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT13Q86X67 352 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC72A6NJI9 287 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TBX1O43435 398 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FMO3P31513 532 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GSK3BP49841 420 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP1Q07960 439 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SUSD3Q96L08 255 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CDK15Q96Q40 435 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TOR1BO14657 336 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA3P01011 423 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CD2P06729 351 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A4P31645 630 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SPIN4Q56A73 249 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FRG2Q64ET8 278 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FRG2BQ96QU4 278 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD5O14737 125 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALT2O43825 422 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ARF5P84085 180 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PITPNAQ00169 270 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT2Q10471 571 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MSS51Q4VC12 460 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OR8H1Q8NGG4 311 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T29Q8NH02 315 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TMBIM1Q969X1 311 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 IFT27Q9BW83 186 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PRKD3O94806 890 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 C8AP07357 584 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 LGI4Q8N135 537 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OR51V1Q9H2C8 321 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MPIP34949 423 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PPP3R1P63098 170 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FAM129CQ86XR2 697 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 STON2Q8WXE9 905 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MGME1Q9BQP7 344 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OR2AG1Q9H205 316 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DAPL1A0PJW8 107 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 WNT9AO14904 365 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO43Q4G163 708 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GALPQ9UBC7 116 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PP18 115 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TPST2O60704 377 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GSTT2BP0CG30 244 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CBSLP0DN79 551 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CBSP35520 551 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CHST4Q8NCG5 386 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FZD4Q9ULV1 537 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF487B1APH4 448 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 C9IYK1 514 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ENGP17813 658 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.93e-7■□□□□ 11
CCSAP-201ENST00000284617 GJA9P57773 515 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MBLAC2Q68D91 279 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms