RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 EFEMP2O95967 443 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 SERPINA1P01009 418 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 S100A3P33764 101 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 HNF1BP35680 557 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF7Q14155 803 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CHRNA6Q15825 494 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 GTDC1Q4AE62 458 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 PHACTR4Q8IZ21 702 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 FAM210AQ96ND0 272 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 ACPTQ9BZG2 426 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 SLC32A1Q9H598 525 aa27.33■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 K7ERQ8 282 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 WNT9AO14904 365 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 PER2O15055 1255 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 CXCL10P02778 98 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 PTPN5P54829 565 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 C16orf87Q6PH81 154 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 PYURFQ96I23 114 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 DEFB118Q96PH6 123 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 RAD21L1Q9H4I0 556 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 OGDHLQ9ULD0 1010 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ITIH1P19827 911 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 GGT5P36269 586 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 VAC14Q08AM6 782 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ABHD18Q0P651 414 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 GGTA1PQ4G0N0 100 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 PAF1Q8N7H5 531 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ARL10Q8N8L6 244 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 TTC16Q8NEE8 873 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 OR6K2Q8NGY2 324 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 NETO1Q8TDF5 533 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ZNF566Q969W8 418 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D20Q96BZ9 403 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 SCLYQ96I15 445 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 TNKS2Q9H2K2 1166 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 SLC6A13Q9NSD5 602 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 BRCA2P51587 3418 aa27.32■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 AGAP14A8MT82 685 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 SLC1A7O00341 560 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 GFRA2O00451 464 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 CCDC159P0C7I6 412 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ITGAMP11215 1152 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 PRPH2P23942 346 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 NSG1P42857 185 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 MAPK10P53779 464 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 TPGS1Q6ZTW0 290 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa27.31■■□□□ 1.96
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UBP1-201ENST00000283628 CSF3RQ99062 836 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 MAPK1P28482 360 aa27.31■■□□□ 1.96
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UBP1-201ENST00000283628 SGCDQ92629 289 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 FKBP10Q96AY3 582 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 NODALQ96S42 347 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 LTB4R2Q9NPC1 389 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 BAG5Q9UL15 447 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 SNX6Q9UNH7 406 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 YIPF1Q9Y548 306 aa27.31■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ABLIM3O94929 683 aa27.3■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 PDYNP01213 254 aa27.3■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 VEPH1Q14D04 833 aa27.3■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 LAIR2Q6ISS4 152 aa27.3■■□□□ 1.96
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UBP1-201ENST00000283628 TCAIMQ8N3R3 496 aa27.3■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 WFDC5Q8TCV5 224 aa27.3■■□□□ 1.96
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UBP1-201ENST00000283628 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
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UBP1-201ENST00000283628 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ARL15Q9NXU5 204 aa27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ENPP5Q9UJA9 477 aa27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
UBP1-201ENST00000283628 ACPPP15309 386 aa27.29■■□□□ 1.96
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