RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TCF25Q9BQ70 676 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HHLA1C9JL84 531 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 NME4O00746 187 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HAT1O14929 419 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 KIAA0355O15063 1070 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TIE1P35590 1138 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR5P61964 334 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 IL18R1Q13478 541 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FBXL22Q6P050 247 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CHST9Q7L1S5 443 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ANKRD46Q86W74 232 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FLCNQ8NFG4 579 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ASB8Q9H765 288 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 NANOGQ9H9S0 305 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SERHLQ9NQF3 203 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 KRBA1A5PL33 1030 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 GABBR2O75899 941 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SERPIND1P05546 499 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 GSTT2P0CG29 244 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 GSTT2BP0CG30 244 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ITGA2P17301 1181 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PFKLP17858 780 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 IL4RP24394 825 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 IST1P53990 364 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 COX10Q12887 443 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TIGD6Q17RP2 521 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 LCN8Q6JVE9 175 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 Q6ZNX1 250 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 RTL10Q7L3V2 364 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SCD5Q86SK9 330 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC34A3Q8N130 599 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PSMG2Q969U7 264 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ARMC5Q96C12 935 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 Q96MT0 163 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 RDH12Q96NR8 316 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF38Q9H0F5 515 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 XPNPEP2O43895 674 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 INMTO95050 263 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HLA-DQB2P05538 268 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CYP2A7P20853 494 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 OPRL1P41146 370 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 KIR3DL1P43629 444 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC16A1P53985 500 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 C1QTNF8P60827 252 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CSNK2BP67870 215 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR153Q6NV75 609 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MAVSQ7Z434 540 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CARM1Q86X55 608 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HMCESQ96FZ2 354 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MYRFLQ96LU7 910 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MARCH5Q9NX47 278 aa11.29□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR81Q562E7 1941 aa11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAJB5O75953 348 aa11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HSD17B1P14061 328 aa11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HNF4AP41235 474 aa11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HSPA7P48741 367 aa11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.28□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms