RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 M0R2N6 131 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 KERAO60938 352 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 SLC1A2P43004 574 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 OMPP47874 163 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 TUBA4AP68366 448 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 HKDC1Q2TB90 917 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.244e-12■■■■■ 55.7
USP22-201ENST00000261497 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 NIPSNAP2O75323 286 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 KAT7O95251 611 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 KLF10Q13118 480 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 LRRC66Q68CR7 880 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 SLC9B2Q86UD5 537 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 GRPEL2Q8TAA5 225 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 PYCR2Q96C36 320 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 REM1O75628 298 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 PTPN5P54829 565 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 NRG3P56975 720 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 ACTR3P61158 418 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 INCA1Q0VD86 236 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 THAP5Q7Z6K1 395 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 SLC34A3Q8N130 599 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 CAMKVQ8NCB2 501 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 SMPDL3AQ92484 453 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 RIT1Q92963 219 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 U3KQV3 271 aa13.52□□□□□ -0.24
USP22-201ENST00000261497 WWP2O00308 870 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 KMOO15229 486 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GJB5O95377 273 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PRLP01236 227 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RLN1P04808 185 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NR4A1P22736 598 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ZNF460Q14592 562 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TMEM156Q8N614 296 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 LRRC57Q8N9N7 239 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 AGAP2Q99490 1192 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CALML5Q9NZT1 146 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PRELID1Q9Y255 219 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 FAM172BPA6NC97 362 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 A8MUA0 341 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 METTL18O95568 372 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 FESP07332 822 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TYRP1P17643 537 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ARHGAP40Q5TG30 622 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PTCHD4Q6ZW05 846 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 OR4E2Q8NGC2 313 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GPR151Q8TDV0 419 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 STRADBQ9C0K7 418 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CDH22Q9UJ99 828 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.52□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 STX16O14662 325 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CNTN5O94779 1100 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ATF6P18850 670 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SGCBQ16585 318 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ZYG11AQ6WRX3 759 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SATL1Q86VE3 508 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GPR174Q9BXC1 333 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 E7ENX8 843 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 K7EPI3 171 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TCEA3O75764 348 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 OR5F1O95221 314 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PRPS2P11908 318 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 IL1R2P27930 398 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PTGS2P35354 604 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GDF10P55107 478 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.51□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 FRMD7Q6ZUT3 714 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms