RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 TTC23LQ6PF05 361 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 MRGPREQ86SM8 312 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 VRK3Q8IV63 474 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 DLG3Q92796 817 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.27■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 EURLQ9NYK6 297 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CDYLQ9Y232 598 aa20.27■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 S1PR4O95977 384 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 CTSBP07858 339 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 MAGP20916 626 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 ALAS2P22557 587 aa20.26■□□□□ 0.83
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NEDD8-201ENST00000250495 UQCRFS1P47985 274 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 ARSFP54793 590 aa20.26■□□□□ 0.83
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NEDD8-201ENST00000250495 C4orf22Q6V702 233 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 PANX3Q96QZ0 392 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 BLACEA4D250 179 aa20.25■□□□□ 0.83
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NEDD8-201ENST00000250495 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 DCAF10Q5QP82 559 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 SLC6A19Q695T7 634 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 MENTQ9BUN1 341 aa20.25■□□□□ 0.83
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NEDD8-201ENST00000250495 ALPPP05187 535 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.24■□□□□ 0.83
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NEDD8-201ENST00000250495 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 RAPSNQ13702 412 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 GRB7Q14451 532 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 SLC9A5Q14940 896 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC6Q86X45 466 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 KRT222Q8N1A0 295 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 MPP5Q8N3R9 675 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 GALNT16Q8N428 558 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 Q8NA96 180 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 NACC2Q96BF6 587 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 IL22Q9GZX6 179 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 P4HTMQ9NXG6 502 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 BFARQ9NZS9 450 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 RASGRF2O14827 1237 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFS3O75489 264 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 MYBPC3Q14896 1274 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2A13Q16696 494 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 TCTE1Q5JU00 501 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-201ENST00000250495 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.23■□□□□ 0.83
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