RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 OR9A1PQ8NGU1 263 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 VPS39Q96JC1 886 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 OR6C1Q96RD1 312 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PKP4Q99569 1192 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SPTBP11277 2137 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPV9 198 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 KDM1AO60341 852 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 EBLN1P0CF75 366 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CDH3P22223 829 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RAB15P59190 212 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS3Q14952 304 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.043e-6■□□□□ 10.7
SYF2-201ENST00000236273 ZIC1Q15915 447 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TTC23LQ6PF05 361 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CEP97Q8IW35 865 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CDKL2Q92772 493 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FMO2Q99518 471 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CPNE1Q99829 537 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PCM1Q15154 2024 aa21.52■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD12Q6UB98 2062 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SPAG6O75602 509 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM155BO75949 473 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FGF5P12034 268 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ITPKBP27987 946 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FOXM1Q08050 763 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CLN3Q13286 438 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TGIF1Q15583 401 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 RBBP8Q99708 897 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FUT8Q9BYC5 575 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM60AQ9NP50 221 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 NFU1Q9UMS0 254 aa21.52■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ISM1B1AKI9 464 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CATP04040 527 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZNF28P17035 718 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 STX2P32856 288 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 GP5P40197 560 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZNF460Q14592 562 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 IL11RAQ14626 422 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TAX1BP1Q86VP1 789 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SPACA3Q8IXA5 215 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PPM1NQ8N819 430 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 LINGO1Q96FE5 620 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PILRAQ9UKJ1 303 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PDE10AQ9Y233 779 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 A0A0J9YY10 115 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ESPNB1AK53 854 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 HCRTR1O43613 425 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB14O43829 449 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TIAF1O95411 115 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SAT1P21673 171 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CD82P27701 267 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 GABRA4P48169 554 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 RGS4P49798 205 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 IL2P60568 153 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 YBX1P67809 324 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 GPR19Q15760 415 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CTAGE3PQ8IX95 158 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 IFT20Q8IY31 132 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 OR2A1Q8NGT9 310 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZNF480Q8WV37 535 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 GPR22Q99680 433 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZPBPQ9BS86 351 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms