RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM74Q86UV6 250 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 AMZ2Q86W34 360 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HORMAD1Q86X24 394 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SFRP1Q8N474 314 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ROPN1LQ96C74 230 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RCN3Q96D15 328 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM161BQ96MY7 647 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PKP4Q99569 1192 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR26Q9H7D7 661 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ACTR8Q9H981 624 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RMI1Q9H9A7 625 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SNX6Q9UNH7 406 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LAMA3Q16787 3333 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PQU0 124 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SHISA7A6NL88 538 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FBP2O00757 339 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PCCBP05166 539 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PDHA2P29803 388 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CASP2P42575 452 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RGS19P49795 217 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PNLIPRP1P54315 467 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ADPRHP54922 357 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DMPKQ09013 629 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RCAN2Q14206 197 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 IRF4Q15306 451 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KIF19Q2TAC6 998 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LIPJQ5W064 366 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 REP15Q6BDI9 236 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SNX31Q8N9S9 440 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GANCQ8TET4 914 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR41Q9HAD4 459 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PP18 115 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM234BA2RU67 622 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PRR19A6NJB7 356 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 C10orf142B7Z368 130 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MAN2B1O00754 1011 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KMOO15229 486 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF4O60810 478 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ENTPD5O75356 428 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC22A3O75751 556 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 JUPP14923 745 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 IMPA1P29218 277 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GCKP35557 465 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HSD17B2P37059 387 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HNF4AP41235 474 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms