RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 VWA8A3KMH1 1905 aa21.62■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TOR1BO14657 336 aa21.62■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINB10P48595 397 aa21.62■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND1CQ8IV53 801 aa21.62■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.62■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 NADKO95544 446 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GRK3P35626 688 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM189BP81408 668 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CARD16Q5EG05 197 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PERM1Q5SV97 790 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX20Q7Z614 316 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 P2RY8Q86VZ1 359 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 RBFAQ8N0V3 343 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ITCHQ96J02 903 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CWH43Q9H720 699 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 LHX3Q9UBR4 397 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM17Q9Y577 477 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1B0GVM2 712 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ASGR1P07306 291 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 FMO3P31513 532 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GBX1Q14549 363 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SGO1Q5FBB7 561 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM4DQ6B0I6 523 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 BOCQ9BWV1 1114 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 APOL5Q9BWW9 433 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD2Q9BX70 525 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 RMND5AQ9H871 391 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 RDH14Q9HBH5 336 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SCN3BQ9NY72 215 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.61■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 MAN1A2O60476 641 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS4O75173 837 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 BMP4P12644 408 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGB6P18564 788 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CA5AP35218 305 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP2K4P45985 399 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 DAPP51397 102 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM165Q9HC07 324 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN3O60637 253 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNDBP1O95273 360 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 KLKB1P03952 638 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 EPB42P16452 691 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 S100A3P33764 101 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 MASP1P48740 699 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 MVKQ03426 396 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SMARCB1Q12824 385 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCA4Q14CN2 919 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 INAQ16352 499 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ELMOD1Q8N336 334 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GLMNQ92990 594 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ABHD8Q96I13 439 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.6■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 AQP9O43315 295 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TWF1Q12792 350 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP4Q13115 394 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GPRC6AQ5T6X5 926 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T5Q6IEZ7 315 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP68Q76N32 757 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS48Q7RTY5 328 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CADM3Q8N126 398 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T29Q8NH02 315 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ULK4Q96C45 1275 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 INPP5KQ9BT40 448 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ACPTQ9BZG2 426 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 NACA2Q9H009 215 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 IL1RAPQ9NPH3 570 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 GJB5O95377 273 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms