RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	BACH1	O14867	736 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	GFRA3	O60609	400 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	BRD1	O95696	1058 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	SSFA2	P28290	1259 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	FOXK2	Q01167	660 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATRX-223	ENST00000637175	SPINT1	O43278	529 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	WEE1	P30291	646 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	SMTN	P53814	917 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	RELB	Q01201	579 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	LAPTM4A	Q15012	233 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	CNKSR1	Q969H4	720 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175		A6NJY4	79 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	ATP2B4	P23634	1241 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	GPC1	P35052	558 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	KCNA1	Q09470	495 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TNS4	Q8IZW8	715 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	CDK2AP1	O14519	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	C21orf2	O43822	256 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	IGFBP4	P22692	258 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	CENPC	Q03188	943 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	PKDCC	Q504Y2	493 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	POTEA	Q6S8J7	498 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	USP3	Q9Y6I4	520 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	MEN1	O00255	615 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	PRMT3	O60678	531 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TLR1	Q15399	786 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	HINFP	Q9BQA5	517 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	FOXO3	O43524	673 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	LGR5	O75473	907 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	NLRP3	Q96P20	1036 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	AAAS	Q9NRG9	546 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	AXIN1	O15169	862 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	UPP2	O95045	317 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	BMP1	P13497	986 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	NBPF15	Q8N660	670 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	RNF217	Q8TC41	542 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	COL26A1	Q96A83	441 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	BMP2	P12643	396 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	TEAD4	Q15561	434 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	EML1	O00423	815 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	ST8SIA5	O15466	376 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	SCNN1A	P37088	669 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	SCARF1	Q14162	830 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	ZFP42	Q96MM3	310 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATRX-223	ENST00000637175	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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