RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-211ENST00000626236 MCM10Q7L590 875 aa11.18□□□□□ -0.62
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SGMS1-211ENST00000626236 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SGMS1-211ENST00000626236 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.03□□□□□ -0.64
SGMS1-211ENST00000626236 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SGMS1-211ENST00000626236 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.02□□□□□ -0.64
SGMS1-211ENST00000626236 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
SGMS1-211ENST00000626236 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SGMS1-211ENST00000626236 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SGMS1-211ENST00000626236 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
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