RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623970.1

ARRDC1-AS1-203, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 2,210 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.78■■■□□ 2.04
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.77■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GNAI2P04899 355 aa27.76■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TEFQ10587 303 aa27.74■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.74■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.73■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.73■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.73■■■□□ 2.03
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RGPD5Q99666 1765 aa27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PXDNQ92626 1479 aa27.7■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BTBD11A6QL63 1104 aa27.7■■■□□ 2.02
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 APBB1O00213 710 aa27.67■■■□□ 2.02
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BCL11AQ9H165 835 aa27.66■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.65■■■□□ 2.02
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ATP8B2P98198 1209 aa27.64■■■□□ 2.02
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.63■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.63■■■□□ 2.01
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HSCBQ8IWL3 235 aa27.63■■■□□ 2.01
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.58■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 COL18A1P39060 1754 aa27.58■■■□□ 2.01
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIF2CQ99661 725 aa27.57■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.57■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.55■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BEND3Q5T5X7 828 aa27.54■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.54■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SSH3Q8TE77 659 aa27.52■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.52■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.52■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ANXA1P04083 346 aa27.52■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.52■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ADCY9O60503 1353 aa27.51■■■□□ 2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.51■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SPG7Q9UQ90 795 aa27.51■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.5■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.5■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.49■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MEGF6O75095 1541 aa27.49■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PHKG2P15735 406 aa27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 POLA2Q14181 598 aa27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GSE1Q14687 1217 aa27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 USP26Q9BXU7 913 aa27.48■■□□□ 1.99
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