RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBTB7AO95365 584 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF428Q96B54 188 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTGER2P43116 358 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 MS4A1P11836 297 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 BTAF1O14981 1849 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP44Q96MT7 982 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PAPPAQ13219 1627 aa21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 NBPF4Q96M43 638 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 YY1P25490 414 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP3K5Q99683 1374 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTFR1LQ9H019 292 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF827Q17R98 1081 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCAPD2Q15021 1401 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPG7Q9UQ90 795 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF853P0CG23 659 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDE3AQ14432 1141 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEGF6O75095 1541 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF16BQ96L93 1317 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKT1S1Q96B36 256 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYT17Q9BSW7 474 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 AAMPQ13685 434 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCM10Q7L590 875 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 MBIPQ9NS73 344 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHL1O00533 1208 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCTN1Q14203 1278 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 BCAR3O75815 825 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TEFQ10587 303 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLIN1O60240 522 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNQ4P56696 695 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARXQ96QS3 562 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 LY75O60449 1722 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRBNQ96SW2 442 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 VAMP4O75379 141 aa21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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