RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC45O75419 566 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEFQ10587 303 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LGR6Q9HBX8 967 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CACNA1FO60840 1977 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC22Q5TAA0 569 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DCCP43146 1447 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHG5O94827 1062 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BTBD11A6QL63 1104 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSCBQ8IWL3 235 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM94Q12767 1356 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APBB1O00213 710 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP8B2P98198 1209 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNX21Q969T3 373 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CASC1Q6TDU7 716 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCL11AQ9H165 835 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERBB3P21860 1342 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ALS2Q96Q42 1657 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP44Q9H0E7 712 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PXDNQ92626 1479 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNQ3O43525 872 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SDSP20132 328 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDE1AP54750 535 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF2CQ99661 725 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GSE1Q14687 1217 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BEND3Q5T5X7 828 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SSH3Q8TE77 659 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPG7Q9UQ90 795 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAB11FIP3O75154 756 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP26Q9BXU7 913 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 REC8O95072 547 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC6O95255 1503 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MX1P20591 662 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HYPKQ9NX55 129 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RGPD5Q99666 1765 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLA2Q14181 598 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADCY9O60503 1353 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RABEP1Q15276 862 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STAP2Q9UGK3 403 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ALDH1L1O75891 902 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERC2O15083 957 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms