RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 RTL1A6NKG5 1358 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 AATKQ6ZMQ8 1374 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.08□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 AK9Q5TCS8 1911 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 AMPHP49418 695 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 DMTNQ08495 405 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ITSN1Q15811 1721 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 RABEP1Q15276 862 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ATP10DQ9P241 1426 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 RILPL2Q969X0 211 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 PTPRUQ92729 1446 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 CASC1Q6TDU7 716 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 RGS12O14924 1447 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 UQCRHLA0A096LP55 91 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 UQCRHP07919 91 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 TBX22Q9Y458 520 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 NEK4P51957 841 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 EYA1Q99502 592 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 DTNBO60941 627 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 PDE1AP54750 535 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 NRKQ7Z2Y5 1582 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 STK31Q9BXU1 1019 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ST18O60284 1047 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 KCNA6P17658 529 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 HMMRO75330 724 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 NLRP6P59044 892 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 ERC2O15083 957 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 PTPRCP08575 1304 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 MPNDQ8N594 471 aa13.02□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
FCHO1-216ENST00000596536 REC8O95072 547 aa13.02□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 GNAI2P04899 355 aa13.02□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 PALD1Q9ULE6 856 aa13.02□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 FLIIQ13045 1269 aa13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 CRB1P82279 1406 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 KLHL40Q2TBA0 621 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 NUCB2P80303 420 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 DYNC1I1O14576 645 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 ANXA1P04083 346 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 LRRCC1Q9C099 1032 aa13□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa12.99□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 USP6P35125 1406 aa12.99□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 KIAA0232Q92628 1395 aa12.99□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKHG3A1L390 1219 aa12.99□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 GDPD2Q9HCC8 539 aa12.99□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM51Q9NW97 253 aa12.99□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 MX1P20591 662 aa12.98□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 RNF214Q8ND24 703 aa12.98□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 GPT2Q8TD30 523 aa12.98□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 TMX3Q96JJ7 454 aa12.98□□□□□ -0.33
FCHO1-216ENST00000596536 IL25Q9H293 177 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms