RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.62■□□□□ 0.89
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CTDP1-207ENST00000591598 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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CTDP1-207ENST00000591598 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.45■□□□□ 0.86
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CTDP1-207ENST00000591598 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 TMX3Q96JJ7 454 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 GCP02774 474 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 PROSER3Q2NL68 480 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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