RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 HFM1A2PYH4 1435 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF223E7ERA6 249 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 CFHP08603 1231 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP7Q8WX94 980 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 AP1G2O75843 785 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 RFX1P22670 979 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC4A3P48751 1232 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 MED14O60244 1454 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ATG7O95352 703 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 LAPTM4AQ15012 233 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 TET3O43151 1660 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 UNC13BO14795 1591 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L8P0C7I0 530 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 CD46P15529 392 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR14Q9BWN1 585 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 S1PR4O95977 384 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SULF1Q8IWU6 871 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 TBX22Q9Y458 520 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNA6P17658 529 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 GGCXP38435 758 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ALG2Q9H553 416 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SLIT1O75093 1534 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.02□□□□□ -0.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 ERCC3P19447 782 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX11P35716 441 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 QPCTQ16769 361 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PIK3C2BO00750 1634 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TOM1O60784 492 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNMO15061 1565 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 E9PCH4 1651 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 MOXD2PA6NHM9 499 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC19A1P41440 591 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 IGSF5Q9NSI5 407 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PLA2G2CQ5R387 149 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 USP35Q9P2H5 1018 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 RGL3Q3MIN7 710 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFYVE9O95405 1425 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 ADH1BP00325 375 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRYD7Q5W111 196 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-216ENST00000590105 IQGAP1P46940 1657 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRB3O60242 1522 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms