RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588305.5

SYT5-205, Transcript of synaptotagmin 5, human

TSL 2

Gene SYT5, Length 931 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYT5-205	ENST00000588305	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	NEFM	P07197	916 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SYT5-205	ENST00000588305	ITPK1	Q13572	414 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	TEF	Q10587	303 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	SPON1	Q9HCB6	807 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	MRC1	P22897	1456 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	ANP32C	O43423	234 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	ZBTB7A	O95365	584 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	SLC39A6	Q13433	755 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.91	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	MCM10	Q7L590	875 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	AK7	Q96M32	723 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SYT5-205	ENST00000588305	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	C5	P01031	1676 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	CASZ1	Q86V15	1759 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	MTFR1L	Q9H019	292 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	LRP5	O75197	1615 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	MSH5	O43196	834 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	C4B	P0C0L5	1744 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	ZNF790	Q6PG37	636 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SYT5-205	ENST00000588305	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	GNPAT	O15228	680 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	PTGER2	P43116	358 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	SSFA2	P28290	1259 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	RIPK4	P57078	832 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	SMIM5	Q71RC9	77 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	PHF14	O94880	888 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	KCNQ3	O43525	872 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SYT5-205	ENST00000588305	RPS6KA4	O75676	772 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	ADRA2B	P18089	450 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	POLD1	P28340	1107 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.03
SYT5-205	ENST00000588305	STARD3NL	O95772	234 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SYT5-205	ENST00000588305	TJP1	Q07157	1748 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SYT5-205	ENST00000588305	MSL1	Q68DK7	614 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SYT5-205	ENST00000588305	ARX	Q96QS3	562 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SYT5-205	ENST00000588305	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SYT5-205	ENST00000588305	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		27.68	■■■□□ 2.02

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