RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 FLT4P35916 1363 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 KIAA0232Q92628 1395 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 SMC5Q8IY18 1101 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 MBIPQ9NS73 344 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 KDRP35968 1356 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 USP54Q70EL1 1684 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 DPYSL4O14531 572 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 FBLN1P23142 703 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 FLIIQ13045 1269 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 TNNQ9UQP3 1299 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ABCC4O15439 1325 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 CHL1O00533 1208 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 PDIA6Q15084 440 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 SKAP1Q86WV1 359 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 RTL1A6NKG5 1358 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 GPR37O15354 613 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 TIE1P35590 1138 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 GCC1Q96CN9 775 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 APBB1O00213 710 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 KCNA6P17658 529 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 PTPRCP08575 1304 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 NUCB1Q02818 461 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 BECN1Q14457 450 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 PEAK1Q9H792 1746 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 CRB1P82279 1406 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 AMPHP49418 695 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 MAP2K5Q13163 448 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPYL6Q8N831 410 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 USP19O94966 1318 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-208ENST00000587914 PIK3C2AO00443 1686 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 AMHR2Q16671 573 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC102AQ96A19 550 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 NUTM2FA1L443 756 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM83GA6ND36 823 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 HOXC9P31274 260 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 IRF6O14896 467 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 EYA1Q99502 592 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 MST1RQ04912 1400 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 DSG2Q14126 1118 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 DCTN1Q14203 1278 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 ABTB2Q8N961 1025 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC39A7Q92504 469 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 IP6K1Q92551 441 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 GOPCQ9HD26 462 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-208ENST00000587914 NWD1Q149M9 1564 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms