RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585326.5

GTF3C2-AS1-202, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 691 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.69□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PHF14O94880 888 aa12.69□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.69□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 AK7Q96M32 723 aa12.69□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.68□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 FYB1O15117 783 aa12.68□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TONSLQ96HA7 1378 aa12.68□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SBF1O95248 1867 aa12.68□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.67□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.67□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.66□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KIF3CO14782 793 aa12.66□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.65□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.65□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SMIM5Q71RC9 77 aa12.65□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 AMIGO3Q86WK7 504 aa12.65□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.64□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 APLP1P51693 650 aa12.64□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.64□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 INSRP06213 1382 aa12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 FLT4P35916 1363 aa12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CYP27B1O15528 508 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SSFA2P28290 1259 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TIAM2Q8IVF5 1701 aa12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 GNPATO15228 680 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LINC00116Q8NCU8 138 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PIGBQ92521 554 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C10orf71Q711Q0 1435 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 DLEC1Q9Y238 1755 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PITPNM1O00562 1244 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TOMM70O94826 608 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SIK1P57059 783 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 BCS1LQ9Y276 419 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NCAPD2Q15021 1401 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MMP10P09238 476 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TJP1Q07157 1748 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TMF1P82094 1093 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NMRK2Q9NPI5 230 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CACNA1SQ13698 1873 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ATP6V1AP38606 617 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ITPK1Q13572 414 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PCNTO95613 3336 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A0A0G2JLW4 131 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CHRDL2Q6WN34 429 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SPG7Q9UQ90 795 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KDRP35968 1356 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 FCHSD2O94868 740 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TGFB2P61812 414 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 HTRA3P83110 453 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SLC24A1O60721 1099 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 EYA1Q99502 592 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.53□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.52□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 DPEP1P16444 411 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C9orf131Q5VYM1 1079 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KLRG1Q96E93 195 aa12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NLGN1Q8N2Q7 840 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 POLKQ9UBT6 870 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.51□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PHKG2P15735 406 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 FKBP8Q14318 412 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ATG3Q9NT62 314 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NRXN2Q9P2S2 1712 aa12.5□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 FSTL1Q12841 308 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 GYS1P13807 737 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RFC4P35249 363 aa12.48□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms