RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	MCM10	Q7L590	875 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	RIPK4	P57078	832 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-223	ENST00000584229	C5	P01031	1676 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	APAF1	O14727	1248 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	KCNQ4	P56696	695 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-223	ENST00000584229	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	PROM2	Q8N271	834 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.74	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	SIK1	P57059	783 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.71	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	TJP1	Q07157	1748 aa		32.71	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GPS1-223	ENST00000584229	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
GPS1-223	ENST00000584229	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	KCNQ3	O43525	872 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	ITPK1	Q13572	414 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	AK7	Q96M32	723 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPS1-223	ENST00000584229	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-223	ENST00000584229	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	GNPAT	O15228	680 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	PHF14	O94880	888 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	GNAI1	P63096	354 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	MSH5	O43196	834 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	CHL1	O00533	1208 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	STARD3NL	O95772	234 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-223	ENST00000584229	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.44	■■■□□ 2.78

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