RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	MRC1	P22897	1456 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	C5	P01031	1676 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-222	ENST00000583983	NEFM	P07197	916 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	ATP6V1A	P38606	617 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	ITPK1	Q13572	414 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	LRP5	O75197	1615 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	TEF	Q10587	303 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	C4B	P0C0L5	1744 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	SLC39A6	Q13433	755 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-222	ENST00000583983	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	ANP32C	O43423	234 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	NFE2L2	Q16236	605 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	MCM10	Q7L590	875 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	AK7	Q96M32	723 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	DCTN1	Q14203	1278 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC184	Q52MB2	194 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-222	ENST00000583983	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF790	Q6PG37	636 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	RUNDC1	Q96C34	613 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	TJP1	Q07157	1748 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	BTBD11	A6QL63	1104 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	GNPAT	O15228	680 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	MSH5	O43196	834 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	SSFA2	P28290	1259 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	PTGER2	P43116	358 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	SMIM5	Q71RC9	77 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	PHF14	O94880	888 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	RIPK4	P57078	832 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	KCNQ3	O43525	872 aa		29	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	RPS6KA4	O75676	772 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
GPS1-222	ENST00000583983	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	ADRA2B	P18089	450 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	POLD1	P28340	1107 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms