RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576460.5

NOMO3-216, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-216ENST00000576460 CYP27B1O15528 508 aa10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 DCAF5Q96JK2 942 aa10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.55□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 SLIT2O94813 1529 aa10.54□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10.54□□□□□ -0.72
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NOMO3-216ENST00000576460 MS4A1P11836 297 aa10.54□□□□□ -0.72
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NOMO3-216ENST00000576460 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.54□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.54□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 USP35Q9P2H5 1018 aa10.54□□□□□ -0.72
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NOMO3-216ENST00000576460 SPOCK2Q92563 424 aa10.53□□□□□ -0.72
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NOMO3-216ENST00000576460 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.53□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.53□□□□□ -0.72
NOMO3-216ENST00000576460 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
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NOMO3-216ENST00000576460 CRBNQ96SW2 442 aa10.47□□□□□ -0.73
NOMO3-216ENST00000576460 MRC1P22897 1456 aa10.47□□□□□ -0.73
NOMO3-216ENST00000576460 ITGB4P16144 1822 aa10.47□□□□□ -0.73
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NOMO3-216ENST00000576460 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.46□□□□□ -0.73
NOMO3-216ENST00000576460 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.46□□□□□ -0.73
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NOMO3-216ENST00000576460 TNS2Q63HR2 1409 aa10.45□□□□□ -0.74
NOMO3-216ENST00000576460 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
NOMO3-216ENST00000576460 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
NOMO3-216ENST00000576460 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
NOMO3-216ENST00000576460 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.45□□□□□ -0.74
NOMO3-216ENST00000576460 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.45□□□□□ -0.74
NOMO3-216ENST00000576460 PTPRCP08575 1304 aa10.44□□□□□ -0.74
NOMO3-216ENST00000576460 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
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NOMO3-216ENST00000576460 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
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