RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574070.5

CLDN7-207, Transcript of claudin 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLDN7, Length 485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-207ENST00000574070 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.89■■□□□ 1.25
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CLDN7-207ENST00000574070 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CLDN7-207ENST00000574070 ATG3Q9NT62 314 aa22.88■■□□□ 1.25
CLDN7-207ENST00000574070 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.87■■□□□ 1.25
CLDN7-207ENST00000574070 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.87■■□□□ 1.25
CLDN7-207ENST00000574070 LY75O60449 1722 aa22.86■■□□□ 1.25
CLDN7-207ENST00000574070 TEFQ10587 303 aa22.86■■□□□ 1.25
CLDN7-207ENST00000574070 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.86■■□□□ 1.25
CLDN7-207ENST00000574070 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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CLDN7-207ENST00000574070 IL17REQ8NFR9 667 aa22.84■■□□□ 1.25
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CLDN7-207ENST00000574070 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.83■■□□□ 1.25
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CLDN7-207ENST00000574070 NFE2L2Q16236 605 aa22.82■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 MRS2Q9HD23 443 aa22.82■■□□□ 1.24
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CLDN7-207ENST00000574070 SYT17Q9BSW7 474 aa22.8■■□□□ 1.24
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CLDN7-207ENST00000574070 SLC39A6Q13433 755 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 RUNDC1Q96C34 613 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 MTFR1LQ9H019 292 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 PAPPAQ13219 1627 aa22.79■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 AKT1S1Q96B36 256 aa22.78■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 RIPK4P57078 832 aa22.77■■□□□ 1.24
CLDN7-207ENST00000574070 NEUROD2Q15784 382 aa22.76■■□□□ 1.23
CLDN7-207ENST00000574070 AK7Q96M32 723 aa22.76■■□□□ 1.23
CLDN7-207ENST00000574070 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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CLDN7-207ENST00000574070 C5P01031 1676 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLDN7-207ENST00000574070 ITPK1Q13572 414 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLDN7-207ENST00000574070 GNPATO15228 680 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN7-207ENST00000574070 PHF14O94880 888 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN7-207ENST00000574070 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN7-207ENST00000574070 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.68■■□□□ 1.22
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CLDN7-207ENST00000574070 APAF1O14727 1248 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN7-207ENST00000574070 KCNQ3O43525 872 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN7-207ENST00000574070 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN7-207ENST00000574070 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN7-207ENST00000574070 GPR162Q16538 588 aa22.66■■□□□ 1.22
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CLDN7-207ENST00000574070 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.66■■□□□ 1.22
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CLDN7-207ENST00000574070 SMIM5Q71RC9 77 aa22.64■■□□□ 1.21
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CLDN7-207ENST00000574070 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.63■■□□□ 1.21
CLDN7-207ENST00000574070 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CLDN7-207ENST00000574070 SSFA2P28290 1259 aa22.63■■□□□ 1.21
CLDN7-207ENST00000574070 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CLDN7-207ENST00000574070 TJP1Q07157 1748 aa22.62■■□□□ 1.21
CLDN7-207ENST00000574070 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.62■■□□□ 1.21
CLDN7-207ENST00000574070 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.62■■□□□ 1.21
CLDN7-207ENST00000574070 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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