RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 TEFQ10587 303 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 GOLGA2Q08379 1002 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 IFT57Q9NWB7 429 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 CABP4P57796 275 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 LY75O60449 1722 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 C5P01031 1676 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 CFAP44Q96MT7 982 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 CHL1O00533 1208 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 KCNQ2O43526 872 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 SLFN5Q08AF3 891 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 PIGBQ92521 554 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGAE-202ENST00000570360 GNAI1P63096 354 aa22.26■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.26■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 EP400Q96L91 3159 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 E9PSI1 815 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 MBIPQ9NS73 344 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.24■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 TJP1Q07157 1748 aa22.23■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.23■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 BTBD11A6QL63 1104 aa22.23■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.23■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 KCNQ3O43525 872 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 SLC39A6Q13433 755 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF790Q6PG37 636 aa22.2■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 ATG3Q9NT62 314 aa22.2■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.2■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.2■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 TRIM37O94972 964 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.18■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 PALLDQ8WX93 1383 aa22.16■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 KRT24Q2M2I5 525 aa22.16■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.15■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ITGAE-202ENST00000570360 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 CACNA1FO60840 1977 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 RREB1Q92766 1687 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 TSPYL6Q8N831 410 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ITGAE-202ENST00000570360 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 SIK1P57059 783 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 ILDR2Q71H61 639 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 HOXB7P09629 217 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 C4BP0C0L5 1744 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 VAMP4O75379 141 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 APBA3O96018 575 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 ITPK1Q13572 414 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 PLSCR1O15162 318 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 ATP6V1AP38606 617 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 USP16Q9Y5T5 823 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGAE-202ENST00000570360 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 KCNQ4P56696 695 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 PROM2Q8N271 834 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 LRRC4BQ9NT99 713 aa22■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 TXNRD1Q16881 649 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGAE-202ENST00000570360 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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