RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	MRS2	Q9HD23	443 aa		12.36	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.36	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		12.36	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	C5	P01031	1676 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	NFE2L2	Q16236	605 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	NEFM	P07197	916 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	CABP4	P57796	275 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	RUNDC1	Q96C34	613 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
DDX19B-215	ENST00000569224	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	TJP1	Q07157	1748 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	MCM10	Q7L590	875 aa		12.32	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		12.32	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.31	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	DCTN1	Q14203	1278 aa		12.31	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	SIK1	P57059	783 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	TEF	Q10587	303 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	KCNQ4	P56696	695 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	RIPK4	P57078	832 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC39A6	Q13433	755 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDX19B-215	ENST00000569224	APAF1	O14727	1248 aa		12.27	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	ITPK1	Q13572	414 aa		12.27	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.27	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	NBPF14	Q5TI25	921 aa		12.27	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.27	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF790	Q6PG37	636 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	MIER1	Q8N108	512 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	BTBD11	A6QL63	1104 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	ATP6V1A	P38606	617 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	NEUROD2	Q15784	382 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	KCNQ3	O43525	872 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		12.23	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.23	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	C4A	P0C0L4	1744 aa		12.23	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		12.23	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	LRP5	O75197	1615 aa		12.22	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.22	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		12.22	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		12.22	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF853	P0CG23	659 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	AK7	Q96M32	723 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	CHL1	O00533	1208 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	WWC1	Q8IX03	1113 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX19B-215	ENST00000569224	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		12.18	□□□□□ -0.46

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