RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.74■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 GNAI3P08754 354 aa28.72■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 LGR6Q9HBX8 967 aa28.7■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 GCP02774 474 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 NCAPD2Q15021 1401 aa28.69■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 SDSP20132 328 aa28.69■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 KIF1AQ12756 1690 aa28.67■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 DDIT3P35638 169 aa28.67■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.67■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 ATP8B2P98198 1209 aa28.66■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.66■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.65■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.65■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 HOXB7P09629 217 aa28.64■■■□□ 2.18
EHD4-202ENST00000569223 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 PXDNQ92626 1479 aa28.63■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.63■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 MCM4P33991 863 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 PDE1AP54750 535 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 USP44Q9H0E7 712 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHG5O94827 1062 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 CASC1Q6TDU7 716 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 USP26Q9BXU7 913 aa28.62■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 KCNQ3O43525 872 aa28.61■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 TEFQ10587 303 aa28.61■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.61■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.6■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.6■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.6■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.6■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 RGPD5Q99666 1765 aa28.59■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 BTBD11A6QL63 1104 aa28.59■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 ALS2Q96Q42 1657 aa28.58■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.58■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.58■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
EHD4-202ENST00000569223 MST1RQ04912 1400 aa28.57■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 RABEP1Q15276 862 aa28.57■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.57■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.56■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.55■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.55■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 SSH3Q8TE77 659 aa28.53■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 MX1P20591 662 aa28.52■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 ERC2O15083 957 aa28.52■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 REC8O95072 547 aa28.52■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.52■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.52■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.51■■■□□ 2.16
EHD4-202ENST00000569223 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.51■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 BEND3Q5T5X7 828 aa28.5■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.49■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 POLA2Q14181 598 aa28.49■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.49■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.49■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 STAP2Q9UGK3 403 aa28.49■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 ADCY9O60503 1353 aa28.49■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 ANXA1P04083 346 aa28.48■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.48■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.48■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.48■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 ERBB3P21860 1342 aa28.48■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.47■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.46■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 AOX1Q06278 1338 aa28.45■■■□□ 2.15
EHD4-202ENST00000569223 RAB11FIP3O75154 756 aa28.45■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.45■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 TRAK2O60296 914 aa28.43■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 IL27Q8NEV9 243 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms