RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 MIER1Q8N108 512 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 ATG3Q9NT62 314 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 MRC1P22897 1456 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 CCER2I3L3R5 266 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 RIPK4P57078 832 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 PALLDQ8WX93 1383 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 TEFQ10587 303 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 RREB1Q92766 1687 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 NEUROD2Q15784 382 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 APAF1O14727 1248 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 KCNQ4P56696 695 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 LY75O60449 1722 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 SLC39A6Q13433 755 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-208ENST00000566059 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.58■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 SIK1P57059 783 aa23.58■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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SPNS1-208ENST00000566059 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 BTBD11A6QL63 1104 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF14Q5TI25 921 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF790Q6PG37 636 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 ATP6V1AP38606 617 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 PAPPAQ13219 1627 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 ITPK1Q13572 414 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-208ENST00000566059 KCNQ3O43525 872 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 AKT1S1Q96B36 256 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 SLC15A2Q16348 729 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF827Q17R98 1081 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 STK32BQ9NY57 414 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC27Q2M243 656 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 C5P01031 1676 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-208ENST00000566059 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.46■■□□□ 1.35
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SPNS1-208ENST00000566059 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 WWC1Q8IX03 1113 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 CHL1O00533 1208 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 C4BP0C0L5 1744 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 TJP1Q07157 1748 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 AK7Q96M32 723 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP44Q96MT7 982 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF853P0CG23 659 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-208ENST00000566059 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 SMIM5Q71RC9 77 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 NGEFQ8N5V2 710 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 GNPATO15228 680 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 IFT57Q9NWB7 429 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 USP16Q9Y5T5 823 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 STARD3NLO95772 234 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 GNAI1P63096 354 aa23.36■■□□□ 1.33
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