RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	LY75	O60449	1722 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	MRC1	P22897	1456 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	PIGB	Q92521	554 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	RREB1	Q92766	1687 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	SOCS7	O14512	581 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	BAG6	P46379	1132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	KCNQ4	P56696	695 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	TEF	Q10587	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	C5	P01031	1676 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	ATG3	Q9NT62	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	TJP1	Q07157	1748 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	KCNQ3	O43525	872 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPL4-208	ENST00000564744	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	PROM2	Q8N271	834 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	PLSCR1	O15162	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	SIK1	P57059	783 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	ITPK1	Q13572	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL4-208	ENST00000564744	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	CHL1	O00533	1208 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	GNAI1	P63096	354 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	POTEH	Q6S545	545 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF521	Q96K83	1311 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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