RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557594.5

NRXN3-215, Transcript of neurexin 3, human

TSL 2 BASIC

Gene NRXN3, Length 3,381 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN3-215	ENST00000557594	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	PTPRC	P08575	1304 aa		11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.5	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	USP25	Q9UHP3	1055 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	MPND	Q8N594	471 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	RGS12	O14924	1447 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	KIF3A	Q9Y496	699 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	ADCY5	O95622	1261 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	DMTN	Q08495	405 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	NUTM2F	A1L443	756 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	ATP7B	P35670	1465 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.46	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	TSC1	Q92574	1164 aa		11.46	□□□□□ -0.57
NRXN3-215	ENST00000557594	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.46	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	MX1	P20591	662 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	NME9	Q86XW9	330 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SSH2	Q76I76	1423 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	CHL1	O00533	1208 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	CHML	P26374	656 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	COG3	Q96JB2	828 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	GNAI2	P04899	355 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	CBX1	P83916	185 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	KDM4A	O75164	1064 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	UBE2H	P62256	183 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	TPM3	P06753	285 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	MCM10	Q7L590	875 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594		F6X3S4	739 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
NRXN3-215	ENST00000557594	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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