RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.73■■□□□ 1.23
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RPS6KL1-209ENST00000555009 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1-209ENST00000555009 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC4A2P04920 1241 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1-209ENST00000555009 HMMRO75330 724 aa22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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RPS6KL1-209ENST00000555009 GPT2Q8TD30 523 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 FOXO3O43524 673 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 PDE1AP54750 535 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 NLRP6P59044 892 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 RBSNQ9H1K0 784 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 SBNO1A3KN83 1393 aa22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 FLT4P35916 1363 aa22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 CRB1P82279 1406 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 TPM2P07951 284 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 F6X3S4 739 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 AMPHP49418 695 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 G2E3Q7L622 706 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGEF10O15013 1369 aa22.64■■□□□ 1.21
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RPS6KL1-209ENST00000555009 NEK4P51957 841 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 HS1BP3Q53T59 392 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 EYA1Q99502 592 aa22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMX3Q96JJ7 454 aa22.63■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.63■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 OFD1O75665 1012 aa22.62■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABTB2Q8N961 1025 aa22.62■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.61■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.61■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 KDRP35968 1356 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 GNAI2P04899 355 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 C14orf37Q86TY3 774 aa22.59■■□□□ 1.21
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RPS6KL1-209ENST00000555009 HOXC9P31274 260 aa22.58■■□□□ 1.21
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RPS6KL1-209ENST00000555009 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.57■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.57■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 BRD1O95696 1058 aa22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 MX1P20591 662 aa22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 MCCP23508 829 aa22.56■■□□□ 1.2
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RPS6KL1-209ENST00000555009 PALD1Q9ULE6 856 aa22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 MBD3O95983 291 aa22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 NWD1Q149M9 1564 aa22.55■■□□□ 1.2
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CHMLP26374 656 aa22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANAPC15P60006 121 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPS6KL1-209ENST00000555009 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 TERF1P54274 439 aa22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATP8B2P98198 1209 aa22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 FLIIQ13045 1269 aa22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 STAP2Q9UGK3 403 aa22.5■■□□□ 1.19
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