RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552899.5

CSRNP2-208, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, human

TSL 4

Gene CSRNP2, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CSRNP2-208	ENST00000552899	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	LTN1	O94822	1766 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	BTAF1	O14981	1849 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	RIPK4	P57078	832 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	GPR162	Q16538	588 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	COG3	Q96JB2	828 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	GNAI1	P63096	354 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSRNP2-208	ENST00000552899	ABCC6	O95255	1503 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	NFAT5	O94916	1531 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	IL13	P35225	146 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	NME9	Q86XW9	330 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	IGHD	P01880	384 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	EXOC5	O00471	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	HSPA6	P17066	643 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRNP2-208	ENST00000552899	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	ADCY9	O60503	1353 aa		13.71	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	RGS3	P49796	1198 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	BECN1	Q14457	450 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	SOX12	O15370	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	LY75	O60449	1722 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	GRIN3B	O60391	1043 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	RLBP1	P12271	317 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	TRIM27	P14373	513 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	POLD1	P28340	1107 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	ERBB3	P21860	1342 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	VAMP4	O75379	141 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	PCNT	O95613	3336 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRNP2-208	ENST00000552899	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CSRNP2-208	ENST00000552899	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23

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