RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 CABP4P57796 275 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 LRP5O75197 1615 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 ATG3Q9NT62 314 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-211ENST00000548041 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.46□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 ZNF827Q17R98 1081 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 IL17REQ8NFR9 667 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 DCTN1Q14203 1278 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 MCM10Q7L590 875 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 SLC39A6Q13433 755 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 NBPF14Q5TI25 921 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 NEFMP07197 916 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 SIK1P57059 783 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 ITPK1Q13572 414 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 NFE2L2Q16236 605 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 SLC15A2Q16348 729 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 MRS2Q9HD23 443 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 STK32BQ9NY57 414 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 TEFQ10587 303 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 AKT1S1Q96B36 256 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 ATP6V1AP38606 617 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 RUNDC1Q96C34 613 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-211ENST00000548041 BCORQ6W2J9 1755 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 RIPK4P57078 832 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 NEUROD2Q15784 382 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 SMIM5Q71RC9 77 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 KCNQ3O43525 872 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 SCN7AQ01118 1682 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 BTBD11A6QL63 1104 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 ZNF790Q6PG37 636 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 APAF1O14727 1248 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 PHF14O94880 888 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 AK7Q96M32 723 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 GNPATO15228 680 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 ZBTB7AO95365 584 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-211ENST00000548041 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 NUP98P52948 1817 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 MSH5O43196 834 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 SSFA2P28290 1259 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 MSL1Q68DK7 614 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 MTFR1LQ9H019 292 aa11.31□□□□□ -0.6
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