RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546560.5

FOXG1-AS1-201, FOXG1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FOXG1-AS1, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KCNQ2O43526 872 aa11.28□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.28□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 AKT1S1Q96B36 256 aa11.28□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 EYA1Q99502 592 aa11.28□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPON1Q9HCB6 807 aa11.28□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CREBZFQ9NS37 354 aa11.27□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NUDCQ9Y266 331 aa11.27□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NEFMP07197 916 aa11.26□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MTHFSP49914 203 aa11.26□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LRRC37A3O60309 1634 aa11.26□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SLC15A2Q16348 729 aa11.25□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.25□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.25□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.25□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.25□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.25□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.24□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.24□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 DCAF5Q96JK2 942 aa11.24□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SBF2Q86WG5 1849 aa11.23□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PRR29P0C7W0 189 aa11.23□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.23□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.22□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.22□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FAM212AQ96EL1 285 aa11.22□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.22□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PEAK1Q9H792 1746 aa11.21□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CABP4P57796 275 aa11.21□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.21□□□□□ -0.61
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CYP27B1O15528 508 aa11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PHKG2P15735 406 aa11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 POLD1P28340 1107 aa11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PPP2R1AP30153 589 aa11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.2□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.19□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 IL13P35225 146 aa11.19□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MTFR1LQ9H019 292 aa11.19□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NHSQ6T4R5 1651 aa11.18□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.18□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.18□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 AK7Q96M32 723 aa11.18□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MEGF6O75095 1541 aa11.18□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 STK25O00506 426 aa11.17□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RASEFQ8IZ41 740 aa11.17□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PIGBQ92521 554 aa11.17□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.17□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ATP6V1AP38606 617 aa11.16□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.16□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RREB1Q92766 1687 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 BTAF1O14981 1849 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FCHSD2O94868 740 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ZBTB7AO95365 584 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HMOX1P09601 288 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NBR1Q14596 966 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.15□□□□□ -0.62
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PALLDQ8WX93 1383 aa11.15□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.14□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SIK1P57059 783 aa11.14□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TEFQ10587 303 aa11.14□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 EP400Q96L91 3159 aa11.14□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NCAPD2Q15021 1401 aa11.14□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.13□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.13□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.13□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ARXQ96QS3 562 aa11.13□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.13□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NGEFQ8N5V2 710 aa11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ATG3Q9NT62 314 aa11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LRP5O75197 1615 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms