RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC27Q2M243 656 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4-211ENST00000533012 TXNRD1Q16881 649 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 NHSQ6T4R5 1651 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC39A6Q13433 755 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF790Q6PG37 636 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 WWC1Q8IX03 1113 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 PALLDQ8WX93 1383 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 PROM2Q8N271 834 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 SBF2Q86WG5 1849 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIK1P57059 783 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 MRC1P22897 1456 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 ATP6V1AP38606 617 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 WDR63Q8IWG1 891 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 CFAP44Q96MT7 982 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHL1O00533 1208 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 KCNQ3O43525 872 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 GNAI1P63096 354 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 IFT57Q9NWB7 429 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4-211ENST00000533012 KCNQ4P56696 695 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 IL16Q14005 1332 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 NBPF14Q5TI25 921 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 BTAF1O14981 1849 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 ITGB4P16144 1822 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF853P0CG23 659 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 ITPK1Q13572 414 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 MBIPQ9NS73 344 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 STARD3NLO95772 234 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 GOLGA2Q08379 1002 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 STK32BQ9NY57 414 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF521Q96K83 1311 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4-211ENST00000533012 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC15A2Q16348 729 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 AK7Q96M32 723 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 USP16Q9Y5T5 823 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 E9PSI1 815 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 AKT1S1Q96B36 256 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLFN5Q08AF3 891 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF827Q17R98 1081 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 LY75O60449 1722 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 GNPATO15228 680 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 RPS6KA4O75676 772 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 KRT24Q2M2I5 525 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4-211ENST00000533012 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96 ms