RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	MRC1	P22897	1456 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	SIK1	P57059	783 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PTPRK-222	ENST00000532751	ANP32C	O43423	234 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	LRP5	O75197	1615 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	ATP6V1A	P38606	617 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	TEF	Q10587	303 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	C4B	P0C0L5	1744 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PTPRK-222	ENST00000532751	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	AK7	Q96M32	723 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	ITPK1	Q13572	414 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	NFE2L2	Q16236	605 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC39A6	Q13433	755 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPRK-222	ENST00000532751	MCM10	Q7L590	875 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBTB7A	O95365	584 aa		29	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		29	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	TJP1	Q07157	1748 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	MSH5	O43196	834 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PTPRK-222	ENST00000532751	GNPAT	O15228	680 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	SSFA2	P28290	1259 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	RIPK4	P57078	832 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	PHF14	O94880	888 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PTPRK-222	ENST00000532751	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.89	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	RPS6KA4	O75676	772 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	PTGER2	P43116	358 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	ADRA2B	P18089	450 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	POLD1	P28340	1107 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	KCNQ3	O43525	872 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	STARD3NL	O95772	234 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	SMIM5	Q71RC9	77 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRK-222	ENST00000532751	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.81	■■■□□ 2.2

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