RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 ATG3Q9NT62 314 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 STK32BQ9NY57 414 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 C4BP0C0L5 1744 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 ANP32CO43423 234 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 NEFMP07197 916 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-208ENST00000531226 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC15A2Q16348 729 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 LRP5O75197 1615 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 SIK1P57059 783 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF827Q17R98 1081 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 TJP1Q07157 1748 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 IL17REQ8NFR9 667 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 AKT1S1Q96B36 256 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-208ENST00000531226 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TEFQ10587 303 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP6V1AP38606 617 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 NFE2L2Q16236 605 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC184Q52MB2 194 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ITPK1Q13572 414 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 MCM10Q7L590 875 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC39A6Q13433 755 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-208ENST00000531226 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 DCTN1Q14203 1278 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 RUNDC1Q96C34 613 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 AK7Q96M32 723 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 MRS2Q9HD23 443 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF790Q6PG37 636 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 BTBD11A6QL63 1104 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 RIPK4P57078 832 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.08■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 C4AP0C0L4 1744 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB7AO95365 584 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 SPON1Q9HCB6 807 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 GNPATO15228 680 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 MTFR1LQ9H019 292 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 SSFA2P28290 1259 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNQ3O43525 872 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 NEUROD2Q15784 382 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 PHF14O94880 888 aa25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 MSH5O43196 834 aa24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 SMIM5Q71RC9 77 aa24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 APAF1O14727 1248 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS6KA4O75676 772 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 PTGER2P43116 358 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 ADRA2BP18089 450 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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