RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517078.1

RNU6-430P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 430, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-430P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-430P-201ENST00000517078 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 WDR44Q5JSH3 913 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 CDC14CA4D256 554 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 ATP1A2P50993 1020 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 PHKA2P46019 1235 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 SMTNP53814 917 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 C4orf17Q53FE4 359 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 ZMYND15Q9H091 742 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-430P-201ENST00000517078 BACH1O14867 736 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 CLDN10P78369 228 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 SV2AQ7L0J3 742 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 OGFOD1Q8N543 542 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 ZNF358Q9NW07 568 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 A0A1B0GTH6 734 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 PLA2G4AP47712 749 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 A6NJY4 79 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 F11P03951 625 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 CCDC102BQ68D86 513 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 GPAMQ9HCL2 828 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 H7C1W4 665 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 CDK2AP1O14519 115 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 RASA1P20936 1047 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 MTFR1Q15390 333 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 GMCL1Q96IK5 515 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP3Q9Y6I4 520 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 SIX5Q8N196 739 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 MSX1P28360 303 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 KRT76Q01546 638 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 DBN1Q16643 649 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 PGBD3Q8N328 593 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-430P-201ENST00000517078 EPHA4P54764 986 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 FOXK2Q01167 660 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 C14orf37Q86TY3 774 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 TNS4Q8IZW8 715 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 CABP1Q9NZU7 370 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 SFI1A8K8P3 1242 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L15C9J2P7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L10C9JJH3 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L12C9JPN9 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L11C9JVI0 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L21D6R901 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L18D6R9N7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L22D6RA61 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L19D6RCP7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L20D6RJB6 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 M0R2N6 131 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 USP17L24Q0WX57 530 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-430P-201ENST00000517078 AIDAQ96BJ3 306 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms