RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.48□□□□□ -1.21
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 OTUD5Q96G74 571 aa7.47□□□□□ -1.21
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PARP2Q9UGN5 583 aa7.47□□□□□ -1.21
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTRQ99707 1265 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBCELQ5QJ74 424 aa7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SORBS3O60504 671 aa7.43□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGD1P98174 961 aa7.43□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPHA4P54764 986 aa7.42□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHA2P01877 340 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGAEP38570 1179 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FANCCQ00597 558 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE3BQ13370 1112 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARID5BQ14865 1188 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPH6Q7L8W6 267 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATCAYQ86WG3 371 aa7.4□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM129BQ96TA1 746 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAPN10Q9HC96 672 aa7.4□□□□□ -1.22
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF76P36508 570 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABTB2Q8N961 1025 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.38□□□□□ -1.23
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