RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.1■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa32.09■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 GAS2L2Q8NHY3 880 aa32.09■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 RNMTO43148 476 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 MTFR1LQ9H019 292 aa32.08■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 LGR6Q9HBX8 967 aa32.08■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa32.08■■■□□ 2.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP6V1AP38606 617 aa32.07■■■□□ 2.72
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RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF831Q5JPB2 1677 aa32.05■■■□□ 2.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 FCHSD2O94868 740 aa32.04■■■□□ 2.72
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RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC00116Q8NCU8 138 aa32.03■■■□□ 2.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 PHACTR3Q96KR7 559 aa32.03■■■□□ 2.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 UBR3Q6ZT12 1888 aa32.03■■■□□ 2.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 GNAT3A8MTJ3 354 aa32.02■■■□□ 2.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 ITPK1Q13572 414 aa32.02■■■□□ 2.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC16A10Q8TF71 515 aa32.02■■■□□ 2.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 MSH5O43196 834 aa32.01■■■□□ 2.71
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RASGEF1B-210ENST00000512716 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
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RASGEF1B-210ENST00000512716 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.95■■■□□ 2.71
RASGEF1B-210ENST00000512716 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 NEFMP07197 916 aa31.94■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 IL17REQ8NFR9 667 aa31.94■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 SGIP1Q9BQI5 828 aa31.94■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 GNPATO15228 680 aa31.93■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 PHF14O94880 888 aa31.93■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 TEFQ10587 303 aa31.93■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 TJP1Q07157 1748 aa31.92■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC39A6Q13433 755 aa31.92■■■□□ 2.7
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RASGEF1B-210ENST00000512716 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.91■■■□□ 2.7
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RASGEF1B-210ENST00000512716 POLD1P28340 1107 aa31.9■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 DLG5Q8TDM6 1919 aa31.9■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 UBR2Q8IWV8 1755 aa31.89■■■□□ 2.7
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RASGEF1B-210ENST00000512716 SMIM5Q71RC9 77 aa31.89■■■□□ 2.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
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RASGEF1B-210ENST00000512716 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
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RASGEF1B-210ENST00000512716 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
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RASGEF1B-210ENST00000512716 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
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