RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512152.5

TAF9-208, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 9, human

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene TAF9, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF9-208	ENST00000512152	SBF2	Q86WG5	1849 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	GNAI1	P63096	354 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.57	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	FAM182B	Q5T319	152 aa		27.56	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	PIGB	Q92521	554 aa		27.56	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152		E9PSI1	815 aa		27.55	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.54	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		27.53	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	PAPPA	Q13219	1627 aa		27.52	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.52	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	KCNQ2	O43526	872 aa		27.52	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.52	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.52	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		27.52	■■■□□ 2
TAF9-208	ENST00000512152	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	ZNF790	Q6PG37	636 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	MBIP	Q9NS73	344 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.48	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		27.47	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		27.47	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	BTAF1	O14981	1849 aa		27.46	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.46	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		27.46	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		27.46	■■□□□ 1.99
TAF9-208	ENST00000512152	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		27.45	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	TRIM37	O94972	964 aa		27.44	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.44	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.44	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		27.44	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	SLC39A6	Q13433	755 aa		27.43	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		27.43	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.41	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	KCNQ3	O43525	872 aa		27.41	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		27.41	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.4	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	PLSCR1	O15162	318 aa		27.4	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	CCDC125	Q86Z20	511 aa		27.4	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		27.4	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	HOXB7	P09629	217 aa		27.39	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
TAF9-208	ENST00000512152	EP400	Q96L91	3159 aa		27.38	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	27.37	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		27.37	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	27.37	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	LY75	O60449	1722 aa		27.36	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.34	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	SIK1	P57059	783 aa		27.34	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
TAF9-208	ENST00000512152	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	APBA3	O96018	575 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	ZNF428	Q96B54	188 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	VAMP4	O75379	141 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.29	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	27.28	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	TJP1	Q07157	1748 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TAF9-208	ENST00000512152	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	C5	P01031	1676 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	BAG6	P46379	1132 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	TXNRD1	Q16881	649 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	PROM2	Q8N271	834 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	ITPK1	Q13572	414 aa		27.24	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		27.24	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	STARD3NL	O95772	234 aa		27.23	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.23	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	27.22	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.22	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	27.22	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.21	■■□□□ 1.95
TAF9-208	ENST00000512152	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	27.21	■■□□□ 1.95

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