RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 SIK1P57059 783 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 PROM2Q8N271 834 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 MRC1P22897 1456 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGB4P16144 1822 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 NGEFQ8N5V2 710 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 RREB1Q92766 1687 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 BTBD11A6QL63 1104 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V1AP38606 617 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC15A2Q16348 729 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 FLAD1Q8NFF5 587 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 MCM10Q7L590 875 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF790Q6PG37 636 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC184Q52MB2 194 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 AK7Q96M32 723 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 LY75O60449 1722 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 APAF1O14727 1248 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 NEUROD2Q15784 382 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 AKT1S1Q96B36 256 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 STARD3NLO95772 234 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 DCTN1Q14203 1278 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC27Q2M243 656 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC39A6Q13433 755 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 ADRA2BP18089 450 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 SSFA2P28290 1259 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNQ4P56696 695 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 ITPK1Q13572 414 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 GNAI1P63096 354 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP44Q96MT7 982 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 PAPPAQ13219 1627 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-208ENST00000504294 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 GNPATO15228 680 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS6KA4O75676 772 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF827Q17R98 1081 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IFT57Q9NWB7 429 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 C5P01031 1676 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CHL1O00533 1208 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MSH5O43196 834 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC10Q8IXB1 793 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SPON1Q9HCB6 807 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 KCPQ6ZWJ8 1503 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087WZG4 1122 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR63Q8IWG1 891 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MIER1Q8N108 512 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MTFR1LQ9H019 292 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IL16Q14005 1332 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 C4BP0C0L5 1744 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 WWC1Q8IX03 1113 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXB7P09629 217 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 RFC4P35249 363 aa18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms