RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496153.5

BUD23-218, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, humanhuman

TSL 4

Gene BUD23, Length 505 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23-218ENST00000496153 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.85■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.85■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 ATG3Q9NT62 314 aa24.85■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.84■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 KCNQ4P56696 695 aa24.84■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 SIK1P57059 783 aa24.84■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.84■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.84■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.84■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 C4BP0C0L5 1744 aa24.83■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 LGR6Q9HBX8 967 aa24.83■■□□□ 1.57
BUD23-218ENST00000496153 ZNF827Q17R98 1081 aa24.82■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 AKT1S1Q96B36 256 aa24.82■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.82■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.81■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 TEFQ10587 303 aa24.81■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 ANP32CO43423 234 aa24.8■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 ATP6V1AP38606 617 aa24.8■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 AK7Q96M32 723 aa24.77■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 SPON1Q9HCB6 807 aa24.77■■□□□ 1.56
BUD23-218ENST00000496153 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.76■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.75■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.75■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 IL17REQ8NFR9 667 aa24.75■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.75■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.74■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.74■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.73■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 MTFR1LQ9H019 292 aa24.73■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 TJP1Q07157 1748 aa24.72■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 ITPK1Q13572 414 aa24.72■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 NFE2L2Q16236 605 aa24.72■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.72■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.72■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 ZBTB7AO95365 584 aa24.71■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
BUD23-218ENST00000496153 MSH5O43196 834 aa24.7■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.7■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 SLC39A6Q13433 755 aa24.69■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 MCM10Q7L590 875 aa24.69■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 BTBD11A6QL63 1104 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 GNPATO15228 680 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 SSFA2P28290 1259 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 ZNF790Q6PG37 636 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 RUNDC1Q96C34 613 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.67■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
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BUD23-218ENST00000496153 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.64■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 PHF14O94880 888 aa24.64■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 DCTN1Q14203 1278 aa24.64■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.64■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
BUD23-218ENST00000496153 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 RIPK4P57078 832 aa24.63■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.63■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 POLD1P28340 1107 aa24.62■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 ADRA2BP18089 450 aa24.61■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.61■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 MRS2Q9HD23 443 aa24.61■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.6■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.6■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 C4AP0C0L4 1744 aa24.59■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 RPS6KA4O75676 772 aa24.59■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 PTGER2P43116 358 aa24.59■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.59■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 STARD3NLO95772 234 aa24.58■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.58■■□□□ 1.53
BUD23-218ENST00000496153 NEUROD2Q15784 382 aa24.57■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.56■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 RFC4P35249 363 aa24.55■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.55■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.55■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 CCDC184Q52MB2 194 aa24.54■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 ARXQ96QS3 562 aa24.54■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
BUD23-218ENST00000496153 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.54■■□□□ 1.52
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