RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495904.1

VSTM2A-207, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 3

Gene VSTM2A, Length 865 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-207ENST00000495904 ZBTB7AO95365 584 aa28.28■■■□□ 2.12
VSTM2A-207ENST00000495904 NFE2L2Q16236 605 aa28.28■■■□□ 2.12
VSTM2A-207ENST00000495904 RUNDC1Q96C34 613 aa28.28■■■□□ 2.12
VSTM2A-207ENST00000495904 LGR6Q9HBX8 967 aa28.27■■■□□ 2.12
VSTM2A-207ENST00000495904 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.27■■■□□ 2.12
VSTM2A-207ENST00000495904 MRC1P22897 1456 aa28.27■■■□□ 2.12
VSTM2A-207ENST00000495904 TEFQ10587 303 aa28.26■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 CCDC184Q52MB2 194 aa28.26■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.26■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.26■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 ITGB4P16144 1822 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 PTGER2P43116 358 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 MTFR1LQ9H019 292 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 PAPPAQ13219 1627 aa28.25■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.24■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.24■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 IL17REQ8NFR9 667 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 ATG3Q9NT62 314 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.22■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM2A-207ENST00000495904 ZNF827Q17R98 1081 aa28.2■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 AKT1S1Q96B36 256 aa28.2■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 RIPK4P57078 832 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 LY75O60449 1722 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 CCER2I3L3R5 266 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 SIK1P57059 783 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 MCM10Q7L590 875 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.14■■■□□ 2.1
VSTM2A-207ENST00000495904 DCTN1Q14203 1278 aa28.12■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.12■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 ATP6V1AP38606 617 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 KCNQ4P56696 695 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 BTBD11A6QL63 1104 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 ARXQ96QS3 562 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 SYT17Q9BSW7 474 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 APAF1O14727 1248 aa28.09■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 NEUROD2Q15784 382 aa28.09■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 ZNF790Q6PG37 636 aa28.09■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.09■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 SLC39A6Q13433 755 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 YY1P25490 414 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 ITPK1Q13572 414 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 POLD1P28340 1107 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 AK7Q96M32 723 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 C5P01031 1676 aa28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-207ENST00000495904 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.01■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 NGEFQ8N5V2 710 aa28■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 FLAD1Q8NFF5 587 aa28■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 CCDC27Q2M243 656 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 MIER1Q8N108 512 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.98■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 C4BP0C0L5 1744 aa27.98■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 STARD3NLO95772 234 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-207ENST00000495904 MSH5O43196 834 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM2A-207ENST00000495904 KCNQ3O43525 872 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM2A-207ENST00000495904 GNPATO15228 680 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-207ENST00000495904 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-207ENST00000495904 SSFA2P28290 1259 aa27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms